Το Τμήμα Μαθηματικών διαιρείται σε 4 Τομείς. Κάθε Τομέας συντονίζει τη διδασκαλία μέρους του γνωστικού αντικειμένου του Τμήματος που αντιστοιχεί σε συγκεκριμένο πεδίο της Επιστήμης των Μαθηματικών:
- Τομέας Εφαρμοσμένης Ανάλυσης: Διαφορικές Εξισώσεις, Μηχανική, Μαθηματική Φυσική.
- Τομέας Θεωρητικών Μαθηματικών: Άλγεβρα, Γεωμετρία, Ανάλυση, Τοπολογία, Θεωρία Συνόλων. (Με απόφαση της Γ.Σ. του Τμήματος Μαθηματικών (συνεδρία 12/29.05.2017) συμπεριλαμβάνει πλέον και τα γνωστικά αντικείμενα του καταργηθέντος Τομέα Παιδαγωγικής, Φιλοσοφίας και Ιστορίας Μαθηματικών: Μαθηματική Παιδεία, Ιστορία και Φιλοσοφία των Μαθηματικών).
- Τομέας Στατιστικής - Θεωρίας Πιθανοτήτων και Επιχειρησιακής Έρευνας: Στατιστική, Θεωρία Πιθανοτήτων, Επιχειρησιακή Έρευνα.
- Τομέας Υπολογιστικών Μαθηματικών και Πληροφορικής: Αριθμητική Ανάλυση, Πληροφορική, Επιστήμη των Υπολογιστών.
H ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΑ ΤΩΝ ΤΟΜΕΩΝ ΕΧΕΙ ΑΝΑΣΤΑΛΕΙ μέχρις ότου αποκατασταθεί η πλήρωση των προϋποθέσεων που θέτει ο νόμος 4597/2022
